বিস্ফোরণ এবং Fasta মধ্যে পার্থক্য

ফাস্টা বিস্ফোরণ

বিস্ফোরণ ও ফাস্টা দুটি সফ্টওয়্যার যা ডিএনএ, আমিনের জৈবিক পরিমাপের তুলনায় ব্যবহৃত হয়। অ্যাসিড, প্রোটিন এবং বিভিন্ন প্রজাতির নিউক্লিওটাইড এবং মিলের সন্ধান করুন। এই অ্যালগরিদমগুলি মনের গতিতে লিখিত ছিল কারণ 1980 এর দশকের মাঝামাঝি সময়ে বিজ্ঞানীদের দ্বারা গবেষণাগারে ডিএনএকে বিচ্ছিন্ন করার ফলে ক্রমবিন্যাসের ডেটা ব্যাটার সূত্রপাত হলে উচ্চ গতিতে আরও গবেষণা করার জন্য সমান জিনের তুলনা করা এবং খুঁজে পাওয়া প্রয়োজন। বিস্ফোরণ বেসিক স্থানীয় সংমিশ্রণ অনুসন্ধান সরঞ্জামের জন্য একটি আদ্যক্ষরা এবং দুটি অনুক্রমের তুলনায় স্থানান্তরের পদ্ধতি ব্যবহার করে। Fasta একটি সফ্টওয়্যার ফাস্ট এ নামে পরিচিত যেখানে A এর জন্য সবগুলি দাঁড়িয়েছে কারণ এটি ডিএনএ সিকোয়েন্সিং এর জন্য দ্রুত A এবং প্রোটিন জন্য ফাস্ট পি এর মতো বর্ণমালার সাথে কাজ করে। উভয় বিস্ফোরণ এবং Fasta কোন জিনোম ডেটাবেস তুলনা খুব দ্রুত হয় এবং তাই খুব ব্যয়বহুল monetarily পাশাপাশি সংরক্ষণ সময় হিসাবে।

বিস্ফোরণ

সর্বাধিক ব্যবহৃত জৈবপ্রযুক্তিক সফ্টওয়্যার বিস্ফোরণে 1990 সালে একটি বিকশিত হয়েছে এবং তারপর থেকে এটি এনসিবিআই সাইটে সবাই পাওয়া যায়। এই সফ্টওয়্যার কোন এক দ্বারা অ্যাক্সেস করা যায় এবং প্রয়োজন প্রয়োজন অনুযায়ী সংশোধন করা যাবে। বিস্ফোরণ হল একটি সফটওয়্যার যার সাথে তুলনা করা একটি ক্রমের ইনপুট ডেটা ফাস্টা ফর্ম্যাটে এবং আউটপুট ডেটা সাধারণ পাঠ্যে পেতে পারে, এইচটিএমএল বা এক্সএমএল বিস্ফোরণ দুটি অনুক্রমের মধ্যে স্থানীয় সমতুল্য অনুসন্ধানের নীতির উপর ভিত্তি করে কাজ করে এবং অনুরূপ অনুক্রমগুলি সংক্ষেপে তালিকাভুক্ত করার পরে এটি আশপাশের সমতুল্য অনুসন্ধান করে। সফ্টওয়্যার অনুরূপ স্থানীয় অঞ্চলের উচ্চ নম্বর জন্য অনুসন্ধান করে এবং একটি থ্রেশহোল্ড মান পৌঁছে পরে ফলাফল দেয়। এই প্রক্রিয়ার পূর্ববর্তী সফ্টওয়্যার থেকে পৃথক যা সম্পূর্ণ অনুক্রম অনুসন্ধান এবং তুলনা অনেক সময় নেয়। বিস্ফোরণটি ডিএনএ ম্যাপিংের মতো বহুবিধ উদ্দেশ্যে ব্যবহার করা হয়, যা বিভিন্ন প্রজাতির দুটি অভিন্ন জিনের সাথে তুলনা করে ফিজোজিনিটি গাছ তৈরি করে।

--২ ->

ফাস্টা

ফাস্টা প্রোগ্রামটি 1985 সালে প্রোটেইনিক শৃঙ্খলাগুলির তুলনা করার জন্য লেখা হয়েছিল কিন্তু পরে ডিএনএ অনুসন্ধান করা হয়েছিল। Fasta সফটওয়্যার পরিসংখ্যানগতভাবে দুটি অনুক্রমের মধ্যে মিল খুঁজে পাওয়ার নীতি ব্যবহার করে। এই সফ্টওয়্যারটি ডিএনএ বা প্রোটিনের এক অনুক্রমের সাথে স্থানীয় শৃঙ্খলা প্রান্তিককরণ পদ্ধতি দ্বারা মেলে। এটি সমতার জন্য স্থানীয় অঞ্চল অনুসন্ধান করে না এবং দুটি অনুক্রমের মধ্যে সেরা ম্যাচ নয়। যেহেতু এই সফটওয়্যার সময়ে সময়ে স্থানীয় সমতুল্য তুলনা করে এটি একটি অসম্পূর্ণ সঙ্গে আসতে পারেন। একটি অনুক্রমে Fasta একটি ছোট অংশ যা k-tuples হিসাবে পরিচিত হয় যেখানে tuple 1 থেকে 6 হতে পারে এবং অন্যান্য অনুক্রমের k-tuples সঙ্গে মেলে এবং একবার মিলিত একটি থ্রেশহোল্ড মান পৌঁছেছেন এটি ফলাফল সঙ্গে আসে আপ আসে। এটি একটি প্রোগ্রাম যা পুরোপুরি দ্রুততার সাথে একটি বড় সংখ্যা থেকে মেলানো অনুক্রমের সম্ভাব্য তালিকার জন্য ব্যবহার করা হয়।

সংক্ষেপে: ফাস্টা বিস্ফোরণ • ফাস্টা থেকে বিস্ফোরণ অনেক দ্রুত। • ফাস্টা তুলনায় বিস্ফোরণটি অনেক বেশি নির্ভুল। • ঘনিষ্ঠভাবে মিলিত ক্রম বিস্ফোরণ জন্য খুব স্পষ্ট এবং অস্পষ্ট ক্রম জন্য Fasta ভাল সফ্টওয়্যার। • বিস্ফোরণ প্রয়োজন অনুযায়ী পরিবর্তিত হতে পারে কিন্তু Fasta পরিবর্তন করা যাবে না। • আউটবাট ডাটা পেতে ফস্টা ইনপুট ফরম্যাট ব্যবহার করতে হবে। • দ্রুতগতির চেয়ে বিস্ফোরণটি অনেক বেশি বহুমুখী এবং ব্যাপকভাবে ব্যবহার করা হয়।