স্যাঙ্গার Sequencing এবং Pyrosequencing মধ্যে পার্থক্য | Sanger Sequencing বনাম Pyrosequencing
কী পার্থক্য - স্যাঙ্গার সিকোএন্সিং বনাম Pyrosequencing
ডিএনএ সিকোয়েন্সিং জ্ঞান যেহেতু ডিএনএ বিশ্লেষণের জন্য খুবই গুরুত্বপূর্ণ একটি বিশেষ ডিএনএ অঞ্চলের সঠিক নিউক্লিওটাইড ব্যবস্থাটি সম্পর্কে এটির অনেক গুরুত্বপূর্ণ তথ্য প্রকাশ করে। বিভিন্ন ডিএনএ সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি আছে। স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিং এবং পিরোউসজেনসিং হচ্ছে মণিকুলার জীববিজ্ঞানে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত দুটি ভিন্ন ডিএনএ সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি। স্যাঙ্গার sequencing এবং Pyrosequencing মধ্যে কী পার্থক্য হচ্ছে স্যাঙ্গার সিকোয়েন্সিং dideoxynucleotides ব্যবহার ডিএনএ সংশ্লেষের বিনষ্ট যখন pyrosequencing নিউক্লিওটাইডের একত্রিত এবং পরিপূরক ক্রম সংশ্লেষিত দ্বারা পাইরোফসফেট মুক্তি সনাক্ত করে সুনির্দিষ্ট অর্ডার পড়তে নিউক্লিওটাইড ক্রম পড়া ক্রম.
সুচিপত্র
1। সংক্ষিপ্ত বিবরণ এবং কী পার্থক্য
2 স্যাঙ্গার এস্কেন্ডিং
3 কি? Pyrosequencing কি
4 সাইড তুলনা দ্বারা সাইড - সিজার সিকিউরিসিং বনাম Pyrosequencing
5 সংক্ষিপ্ত বিবরণ
স্যাঙ্গার এস্কেন্ডিং কি?
স্যাঙ্গার সিকোয়েন্সিং একটি প্রথম প্রজন্মের ডিএনএ সিকোয়েন্সিং 1977 সালে ফ্রেডেরিক স্যাঙ্গার ও তার কলেজ দ্বারা উন্নত পদ্ধতি এটি হিসাবে পরিচিত হয় হল চেন সমাপন সিকোএন্সিং অথবা Dideoxy সিকোয়েন্সিং যেহেতু এটি উপর ভিত্তি করে তৈরি ডাইডিক্সিনে নিউক্লিওটাইডস (ডিডিএনএনপিপিএস) দ্বারা শৃঙ্খল অবসান এই পদ্ধতিটি ব্যাপকভাবে 30 বছরেরও বেশি সময় ধরে ব্যবহার করা হয়েছিল যতক্ষণ না নতুন জেনারেশন সেকেন্ডিং (এনজিএস) তৈরি করা হয়। স্যাঞ্জার সিকেন্ডিং টেকনিকটি সঠিক নিউক্লিওটাইডের ক্রম বা একটি বিশেষ ডিএনএ টুকরো সংযুক্তির আবিষ্কারকে সক্ষম করে। এটা তোলে ভিট্রো ডিএনএ রেপ্লিকেশন সময় ddNTPs এর নির্বাচনী নিগম এবং ডিএনএ সংশ্লেষণ অবসান উপর ভিত্তি করে। 3 'ওহো গ্রুপের অনুপস্থিতি সন্নিহিত নিউক্লিওটাইডের মধ্যে ফসফোডিয়েস্টার বন্ড গঠন চালিয়ে যাওয়ার একটি বিশেষ বৈশিষ্ট্য হলো ডিডিএনএএনপিপিগুলির একটি অনন্য বৈশিষ্ট্য। অতএব, একবার ddNTP সংযুক্ত করা হয়, চেন প্রসারিত বন্ধ এবং যে বিন্দু থেকে অবসান। চারটি DDNTPs আছে - DDATP, ddCTP, ddGTP এবং ddTTP - Sanger sequencing ব্যবহৃত। এই নিউক্লিওটাইড ডিএনএ রেপ্লিকেশন প্রক্রিয়াটি বন্ধ করে দেয় যখন ডিএনএ ক্রমবর্ধমান প্রান্তে ঢোকানো হয় এবং এর ফলে ছোট ডিএনএ-এর দৈর্ঘ্য ভিন্ন হয়। কৈশিলার জেলের ইলেক্ট্রোফোরিসিসটি এই ছোট ডিএনএ সারগুলি একটি আকারের জেলের আকার দ্বারা সংগঠিত করার জন্য ব্যবহার করা হয় যেমন ছবি 01 তে দেখানো হয়েছে।
--২ ->
চিত্র 1: সংশ্লেষিত ছোট ডিএনএর কৈশিক জেল ইলেক্ট্রোফোরিয়সিসে
ইন ভিট্রো ডিএনএ'র প্রতিলিপি, কয়েকটি প্রয়োজনীয়তা প্রদান করা উচিত। তারা ডিএনএ পলিমেরেজ এনজাইম, টেমপ্লেট ডিএনএ, অলিগনোকিওলাইটিড প্রাইমার্স এবং ডোক্সিনেক্লিওটাইড (ডিএনটিপি)। স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিংয়ে ডিএনএ রেপ্লিকেশনটি চারটি পৃথক পরীক্ষা টিউবসহ চার ধরনের ডিডিএনটিপিগুলি পৃথকভাবে সঞ্চালিত হয়। Deoxynucleotides সংশ্লিষ্ট DDNTPs দ্বারা সম্পূর্ণরূপে প্রতিস্থাপিত হয় না। বিশেষ ডিএনটিপি (উদাহরণস্বরূপ; ডিএটিপি + ডিডিএটিপি) একটি মিশ্রণ টিউবটিতে অন্তর্ভুক্ত এবং প্রতিলিপি করা হয়। চার পৃথক টিউব পণ্য চার পৃথক কূপ একটি জেল চালানো হয়। তারপর জেলটি পড়ার দ্বারা চিত্র 02.
হিসাবে দেখানো হিসাবে ক্রম তৈরি করা যায়। --3 ->
চিত্র 02: স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিং
স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিং একটি গুরুত্বপূর্ণ কৌশল যা আণবিক জীববিজ্ঞানের অনেক অঞ্চলে সহায়তা করে। মানব জিনোম প্রকল্প সফলভাবে Sanger শৃঙ্খলা ভিত্তিক পদ্ধতির সাহায্যে সম্পন্ন হয়েছে। Sanger sequencing লক্ষ্য ডিএনএ sequencing, ক্যান্সার এবং জেনেটিক রোগ গবেষণা, জিন এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ, মানব সনাক্তকরণ, প্যাথোজেন সনাক্তকরণ, মাইক্রোবাইল sequencing ইত্যাদি ক্ষেত্রেও দরকারী।
Sanger সিকোয়েন্সিং এর বেশ কয়েকটি অসুবিধা আছে:
- ডিএনএ দৈর্ঘ্য শৃঙ্খলাবদ্ধ 1000 বেস জোড়া বেশী হতে পারে না
- শুধুমাত্র একটি strand একটি সময়ে sequenced হতে পারে।
- প্রক্রিয়াটি সময় ব্যয়কারী এবং ব্যয়বহুল।
অতএব, এই সমস্যার সমাধান করার জন্য নতুন উন্নত সিকোয়েন্সিং কৌশলগুলি উন্নত করা হয়েছে। যাইহোক, প্রায় 850 বেস জোড়া লম্বা টুকরা পর্যন্ত তার যথাযথ ফলাফলের কারণে Sanger শৃঙ্খলা এখনও ব্যবহার করা হয়।
পিরোজেকসিংসিং কি?
Pyrosequencing একটি উপন্যাস "সংশ্লেষণ দ্বারা sequencing" উপর ভিত্তি করে একটি উপন্যাস ডিএনএ sequencing কৌশল। এই টেকনিক নিউক্লিওটাইড নিগম উপর pyrophosphate রিলিজ আবিষ্কার উপর নির্ভর করে। এই প্রক্রিয়াটি চারটি ভিন্ন এনজাইম দ্বারা নিযুক্ত করা হয়: ডিএনএ পলিমার্স, এ.টি.পি সিলফিরেলস, লুইফেরেজ এবং অ্যারিরেস এবং দুইটি উপসর্গ অ্যাডেনোসিন 5 'ফসফোসফেট (এপিএস) এবং লুইফেরিন।
প্রক্রিয়াকরণটি একক-বিভক্ত ডিএনএ টেমপ্লেট দিয়ে প্রাইমারের বাইন্ডিং এর সাথে শুরু হয় এবং ডিএনএ পলিমারেজ এটির পরিপূরক নিউক্লিওটাইডের প্রবর্তন শুরু করে। যখন নিউক্লিওটাইড একত্রিত হয় (নিউক্লিক এসিড পলিমারাইজেশন), তখন এটি পাইরোফসফেট প্রকাশ করে (দুটি ফসফেট গ্রুপ একত্রে আবদ্ধ) গ্রুপ এবং শক্তি। প্রতিটি নিউক্লিওটাইড যোগব্যায়াম পিরফোস্কিটের সমমল পরিমাণ প্রকাশ করে। পিট্রোফসফেট এট্রিপটি এপিএসের উপস্থিতিতে এ.পি. উত্পন্ন ATP luciferase-mediated luciferin থেকে oxyluciferin যাও রূপান্তরের রূপান্তর, পরিমাণ পরিমাণে যে ATPs পরিমাণ সমানুপাতিক উত্পাদন দৃশ্যমান। হালকা একটি ফোটন সনাক্তকরণ ডিভাইস বা photomultiplier দ্বারা সনাক্ত করা হয় এবং একটি pyrogram তৈরি করে। প্রতিক্রিয়া মিশ্রণে ATP এবং অ-অন্তর্ভুক্ত DNTPs হ্রাস পায়। DNTP উপরন্তু একটি সময়ে একবার করা হয়। যেহেতু নিউক্লিওটাইডের যোগফলকে আলোর সংমিশ্রণ ও সনাক্তকরণ অনুযায়ী পরিচিত করা হয়, তাই টেমপ্লেটের ক্রম নির্ধারণ করা যেতে পারে।চিত্র 03. এ বর্ণিত নমুনা ডিএনএ নিউক্লিওটাইডের ক্রম উৎপন্ন করার জন্য পাইরোগ্রামটি ব্যবহার করা হয়।
একক নিউক্লিওটাইড পলিমারফিজম বিশ্লেষণে ডিএনএ-এর ছোট অংশগুলির ক্রমিংয়ের জন্য Pyrosequencing খুবই গুরুত্বপূর্ণ। উচ্চ নির্ভুলতা, নমনীয়তা, অটোমেশন এবং সমান্তরাল প্রক্রিয়াজাতকরণ সহজতর Sanger শৃঙ্খলা কৌশল উপর pyrosequencing এর সুবিধা।
চিত্র 03: Pyrosequencing
সঞ্জার শৃঙ্খলা এবং Pyrosequencing মধ্যে পার্থক্য কি?
- টেবিল থেকে প্রান্তিক প্রান্তিক মধ্যম ->
সিজার সিকোয়েন্সিং বনাম পিরোজেকেনসিং |
|
| স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিং হল একটি ডিএনএ সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি যা ডিএনএএনপিএনএর ডিএনএএনপিএন ডিএনএ পলিমারেজ এবং চেইন রিমাইন্ডেশন দ্বারা গঠিত। | পাইউরোজেন্সিং হচ্ছে ডিএনএ সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি যা নিউক্লিওটাইডের সংমিশ্রণে পাইরোফসফেট রিলিজের সনাক্তকরণের উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয়। |
| ডি.ডি.এন.টি.পি. | |
| ডি.এন.এন.এন.পি. ব্যবহার ডিএনএ রেপ্লিকেশন বন্ধ করার জন্য ব্যবহৃত হয় | ডি.এন.এন.এন.পি. ব্যবহার করা হয় না। |
| এনজাইম জড়িত | |
| ডিএনএ পলিমারেজ ব্যবহার করা হয়। | চারটি এনজাইম ব্যবহার করা হয়: ডিএনএ পলিমারেজ, এ.টি.পি. সালাফিরালেস, লুইফেরেজ এবং অ্যারোইজার। |
| ব্যবহৃত উপসেট | |
| এপিএস এবং লুইফেরিন ব্যবহার করা হয় না। | অ্যাডেনোসিন 5 'ফসফোসফেট (এপিএস) এবং লুইফেরিন ব্যবহার করা হয়। |
| সর্বোচ্চ তাপমাত্রা | |
| এটি একটি ধীর প্রক্রিয়া। | এটি একটি দ্রুত প্রক্রিয়া। |
সংক্ষিপ্ত বিবরণ - স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিং বনাম পিরোজেকেনসিং
স্যাঞ্জার সিকেন্ডিং এবং পিরোজেকেনসিং হচ্ছে দুই ডিএনএ সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি যা আণবিক জীববিজ্ঞানে ব্যবহৃত হয়। স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিং ক্রম অনুসারে নিউক্লিওটাইডের ক্রম গঠন করে এবং শৃঙ্খলা বৃদ্ধির অবসান ঘটায় এবং pyrosequencing নিউক্লিওটাইডগুলির নিউক্লিওটাইডগুলির সুনির্দিষ্ট আদেশ তৈরি করে এবং নিউট্রিয়োটাইটিস দ্বারা গঠিত পিউরোফসফেটগুলি প্রকাশ করে। অতএব, Sanger sequencing এবং Pyrosequencing মধ্যে প্রধান পার্থক্য যে Sanger sequencing শৃঙ্খলা অবসান দ্বারা ক্রম ক্রিয়া উপর কাজ করে যখন pyrosequencing সংশ্লেষণ দ্বারা ক্রম উপর কাজ করে।
রেফারেন্স:
1 ফকরুদ্দীন, মো। ও অভিজিত চৌধুরী। "Pyrosequencing- ঐতিহ্যবাহী Sanger Sequencing একটি বিকল্প। "আমেরিকান জৈব রসায়ন ও জৈবপ্রযুক্তি জার্নাল। বিজ্ঞান প্রকাশনা, 02 মার্চ 2012. ওয়েব। ২8 ফেব্রুয়ারি ২017.
২। "স্যাঙ্গারের সিকোয়েন্সিং "স্যাঙ্গার সিকোয়েন্সিং - সায়েন্স ডাইরেক্ট টপিকস। এন। পি।, এন ঘ। ওয়েব। ২8 ফেব্রুয়ারি 2017
চিত্র সৌজন্যে:
1 "ডাইসডক্সি মেথড" ক্রিস্টোফ গোমেনস (মোডিফিজিরিট) - ডঃ নর্মান ম্যডের, অফ বেসিস ইনার ডেইলি ভন ক্রিস্টোফ গোলামস (সিসি বাই-এসএ 3. 0) কমন্সে উইকিমিডিয়া
২। "স্যাঙ্গার-ডিএনএ-সিক" পোলিশ ভাষায় উইকিপিডিয়া (সিসি বাই-এসএ 3. 0) এঞ্জোর মাধ্যমে কমন্স উইকিমিডিয়া
3। মাইক্রোবায়োলজিবিটস দ্বারা "পিরোজেকেনসিং" (সিসি বাই-এসএ ২.0) ফ্লিকারের মাধ্যমে
