RT PCR এবং QPCR এর মধ্যে পার্থক্য | আরপি পিসিআর বনাম QPCR
কী পার্থক্য - আরপি পিসিআর বনাম QPCR
পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশনটি একটি নির্দিষ্ট অঞ্চলের ডিএনএ ইন vitro এ প্রসারিত করতে ব্যবহৃত হয়। 1983 সালে কার মুলিসের এই কৌশল আবিষ্কারের কারণে বিজ্ঞানীরা গবেষণার উদ্দেশ্যে নির্দিষ্ট ডিএনএ টুকরাগুলির লক্ষ লক্ষ কপি তৈরি করতে সক্ষম। বর্তমানে এটি একটি বিস্তৃত বিভিন্ন অ্যাপ্লিকেশনের জন্য ক্লিনিকাল এবং গবেষণা ল্যাবরেটরিতে একটি সাধারণ এবং নিয়মিতভাবে সঞ্চালিত কৌশল হয়ে উঠেছে। আরপি পিসিআর, নেস্টেড PCR, মাল্টিপ্লেক্স PCR, Q PCR, RTP- QPCR ইত্যাদি হিসাবে প্রথাগত PCR কৌশলর বৈচিত্র রয়েছে। RT PCR এবং Q PCR হল PCR এর দুটি গুরুত্বপূর্ণ পরিবর্তন। আর.পি.পি.আর এবং ক PCR- এর মূল পার্থক্য হল যে আরটি পিসিআরটি সম্পূরক ডিএনএ (সিডিএনএ) আরএনএ এর সংকলনের মাধ্যমে Q PCR ব্যবহার করে জিন এক্সপ্রেশন সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়। পরিমাণগতভাবে পিসিআর পণ্যগুলিকে ফ্লোরসেন্ট ডিয়াস ব্যবহার করে বাস্তব সময় পরিমাপ করে।
সুচিপত্র
1। সংক্ষিপ্ত বিবরণ এবং কী পার্থক্য
2 আরটি পিসিআর
3 কি? কি কি QPCR
4 সাইড তুলনা দ্বারা সাইড - RT PCR বনাম QPCR
5 সারাংশ
আরটি পিসিআর কি?
ট্রান্সক্রিপশন পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশন (আর.টি. PCR) বিপরীত হয় PCR এর একটি বৈকল্পিক যা RNA এক্সপ্রেশন সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়। টিস্যুতে এমআরএনএ এক্সপ্রেশন সনাক্ত করার জন্য এটি একটি অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ পদ্ধতি। আরপি পিসিআর নিযুক্ত করা হয় যখন নমুনা এর শুরু উপাদান আরএনএ আর.টি. PCR- তে, টেমপ্লেট mRNA প্রথম পরিপূরক ডিএনএ রূপান্তরিত হয়। এই পদক্ষেপ এনজাইম বিপরীত ট্রান্সক্র্যাশটেজ দ্বারা অনুঘটক হয় এবং প্রক্রিয়া রিভার ট্রান্সক্রিপশন নামে পরিচিত। দ্বিতীয়ত, ঐতিহ্যগত PCR সম্প্রসারণের জন্য সদ্য সংশ্লেষিত সিডিএনএর জন্য নিযুক্ত করা হয়।
--২ ->আরটি পিসিআর একটি অত্যন্ত সংবেদনশীল কৌশল যার জন্য অপেক্ষাকৃত ক্ষুদ্র পরিমাণে আরএনএন নমুনা প্রয়োজন। আর.টি.পি.সি. সাধারণত এএনএনএ প্রজাতির নির্ণয় ও পরিমাণে ব্যবহৃত হয়, বিশেষ করে এইচএনএর ভাইরাস যেমন হিউম্যান ইমিউনোডাইফাইসিটি ভাইরাস এবং হেপাটাইটিস সি ভাইরাস।
চিত্র 01: আরটি পিসিআর টেকনিক
QPCR কি?
পরিমাণগত পিসিআর (QPCR) হল PCR এর একটি বৈকল্পিক যা পরিমাণে PCR পণ্যগুলি পরিমাপের জন্য ব্যবহৃত হয়। রিয়েল টাইম পলিমারেজ শিকল প্রতিক্রিয়া হিসাবে এটিও বলা হয় কারণ এটি বাস্তব সময় PCR মেশিন ব্যবহার করে রিয়েল টাইমের বিস্তারকে পরিমাপ করে। এটি একটি নমুনা উপস্থিত একটি লক্ষ্য ক্রম বা জিন পরিমাণ নির্ধারণ করার জন্য একটি উপযুক্ত পদ্ধতি। QPCR এর আকর্ষণীয় বৈশিষ্ট্য হচ্ছে এটি একক ধাপে উভয় প্রসারণীয়তা এবং সত্যিকার পরিমানের সংমিশ্রণকে একত্রিত করে। অতএব, সনাক্তকরণের জেল ইলেক্ট্রোফোরিসিসের প্রয়োজনটি QPCR টেকনিক দ্বারা দূর করা যেতে পারে। PCP প্রতিক্রিয়াগুলির সময় QPCR পিসিআর পণ্যের লেবেল করার জন্য ফ্লোরসেন্ট ডিয়েন্স ব্যবহার করে যা অবশেষে সরাসরি মাত্রা পরিমাপের দিকে পরিচালিত করে।যখন পিসিআর পণ্য জমা হয়, তখন ফ্লোরসেন্ট সংকেত জমা হয় এবং এটি বাস্তব সময় মেশিন দ্বারা পরিমাপ করা হবে। QPCR RT PCR- এর সাথে মিলিত হতে পারে এটি আরটি - QPCR বা QRT - PCR নামে পরিচিত এবং এটি কোষ বা টিস্যুতে আরএনএ স্তর সনাক্তকরণের জন্য সবচেয়ে শক্তিশালী, সংবেদনশীল এবং পরিমাণগত পদ্ধতি হিসেবে বিবেচিত।
সি.আই.বি.আর. গ্রীন এবং তাকমানের দুটি পদ্ধতি হল বাস্তব সময়ের PCR- র প্রসপেক্টেশন প্রক্রিয়া সনাক্ত বা পর্যবেক্ষণ করা। SYBR সবুজ পদ্ধতিটি একটি ফ্লোরসেন্ট ডাই এর সাহায্যে সি.আই.আই.বি.র. গ্রীন ব্যবহার করে এবং দ্বি-দুর্গন্ধযুক্ত ডিএনএ উৎপাদনে রঞ্জনকে বাঁধার মাধ্যমে উদ্দীপক সনাক্ত করে। Taqman দ্বৈত - লেবেলযুক্ত অনুসন্ধান ব্যবহার করে সম্পন্ন হয় এবং Taq polymerase দ্বারা তদন্তের পতন এবং ফ্লুরোফোরের প্রকাশ প্রকাশ করে চিত্র ২2-এ দেখানো হয়। উভয় পদ্ধতিই প্রসপেক্টেশন প্রক্রিয়ার অগ্রগতি নিরীক্ষণ করে এবং পণ্যের প্রকৃত সময়ের পরিমাণ প্রতিবেদন করে ।
রিয়েল টাইম PCR- এর বিভিন্ন ধরণের অ্যাপ্লিকেশন যেমন জিন এক্সপ্রেশন কোয়ানিফিকেশন, মাইক্রোআরএনএ এবং অ্যানকোডিং আরএনএ বিশ্লেষণ, এসএনপি জিনোটাইপ, কপি নম্বরের চরিত্রগুলির সনাক্তকরণ, বিরল পরিব্যক্তি সনাক্তকরণ, জেনেটিকালি মডিফাই করা জীবাণু সনাক্তকরণ, সংক্রামক এজেন্ট সনাক্তকরণ ইত্যাদি। ।
চিত্র 02: পরিমাণগত পিসিআর কৌশল
আরটি পিসিআর এবং কিউপিআরসি'র মধ্যে পার্থক্য কি?
- টেবিল থেকে প্রান্তিক প্রান্তিক মধ্যম ->
আরপি পিসিআর বনাম QPCR |
|
আরটি পিসিআর একটি কৌশল যা প্রজনন দ্বারা জিন অভিব্যক্তি সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়। | QPCR হল একটি টেকনিক যা ডিএনএ বৃদ্ধি করে এবং পিসিআর পণ্যকে বাস্তব সময়ে পরিমাপ করে। |
বিপরীত ট্রান্সক্র্যাশটেজ এনজাইমের অন্তর্ভুক্তি | |
এনজাইম বিপরীত ট্রান্সক্র্যাশটিটি RT পিসিআর এর জন্য ব্যবহৃত হয় | এনজাইম বিপরীত ট্রান্সক্র্যাশেটি QPCR এর জন্য ব্যবহার করা হয় না। |
ফ্লোরোসেন্টলি লেবেলেড অণুগুলির ব্যবহার | |
আরপি পিসির জন্য আলাদাভাবে লেবেলযুক্ত ডাইজ বা প্রোব ব্যবহার করা হয় না | QPCR- র জন্য আলাদাভাবে লেবেলযুক্ত ডাইজ বা প্রোবের ব্যবহার করা হয়। |
পিসিআর পণ্য পরিমাপ | |
QPCR এর সাথে সংযুক্ত না হওয়া পর্যন্ত, আর.টি. PCR পিসিআর পণ্য পরিমাপ করে না। | QPCR পরিমাণগতভাবে PCR পণ্য পরিমাপ। |
উপাদান শুরু হচ্ছে | |
উপাদান শুরু হচ্ছে mRNA | উপাদান শুরু হচ্ছে ডিএনএ। |
সিডিএনএ এর সংশ্লেষণ | |
সম্পূরক ডিএনএটি আর.টি. পি.সি.আর এর সময় উৎপন্ন হয়। | QPCR এর সময় সম্পূরক ডিএনএ উত্পন্ন হয় না। |
সারসংক্ষেপ - আরপি পিসিআর বনাম QPCR
আরটি পিসিআর এবং QPCR প্রথাগত PCR এর দুটি সংস্করণ। আরটি পি.সি.আর টেকনিক এমআরএনএ নমুনার জন্য সঞ্চালিত হয় এবং এটি রিভার্স ট্রান্সক্রিপশন এবং সিডিএনএ উৎপাদন দ্বারা চালিত হয়। QPCR ব্যবহার করা হয় PCR তাপের চক্রের সাথে সময়সীমার সময় PCR তাপমাত্রা ব্যবহার করে ফ্লোরসেন্ট ডিজাইন বা লেবেলযুক্ত অনুসন্ধানগুলি। QPCR- তে, পিসিআর পণ্যের পরিমাণ নমুনা দ্বারা নির্গত ফ্লোরোসেন্ট সংকেত দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয়। আরপি পিসির জনপ্রিয়তা একটি প্রসারমান প্রক্রিয়া হিসাবে ব্যবহৃত হয় যখন QPCR সাধারণত একটি মাত্রা প্রক্রিয়া হিসাবে ব্যবহৃত হয়। এটি আরটি পিসিআর এবং QPCR এর মধ্যে পার্থক্য।
রেফারেন্সগুলি:
1। দীপক, এসএ, কেআর কোটাপল্লী, আর। রাকওয়াল, জি। অর্স, কে.এস. রাঙ্গাপ্পা, এইচ। ইভাহাশী, ই। মাসুও, এবং জি কে আগরাল। "রিয়েল-টাইম পিসিআর: জিনসের বিপ্লব সনাক্তকরণ এবং এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ। "বর্তমান জিনোমিক্সবেথহাম সায়েন্স পাবলিশার্স লিঃ, জুন ২007. ওয়েব। 03 এপ্রিল। 2017
২ জেকা, ফজাল্লাবা, ক্যাট্রিয়েন ভান্ডারহেদেন, এলস দে স্মেট, ক্লড এ। কুউভেলায়ার, পিটার মস্তদাগ, ও জো ভেন্ডেসোম্পেলে। "সহজবোধ্য এবং সংবেদনশীল RT-qPCR ভিত্তিক জিন এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ FFPE নমুনা। "প্রকৃতি সংবাদ প্রকৃতি প্রকাশনা দল, ২২ ফেব্রুয়ারি 2016. ওয়েব 03 এপ্রিল ২01২
3 Overbergh, এল, এ Giulietti, ডি Valckx, বি Decallonne, আর। Bouillon, এবং সি Mathieu। "সিনটোকিন জিন এক্সপ্রেশনের পরিমাণ নির্ণয়ের জন্য রিয়েল-টাইম বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্যাটের PCR ব্যবহার। "জৈবিকাল প্রযুক্তি জার্নাল: জেবিটি জৈবোলিকাল রিসোর্স সুবিধার অ্যাসোসিয়েশন, মার্চ 2003. ওয়েব। 03 এপ্রিল। 2017
চিত্র সৌজন্যে:
1 "Taqman" ব্যবহারকারীর দ্বারা: ব্রাইডামেজেড - মূল আপলোডার (পাবলিক ডোমেন) এর মাধ্যমে কমন্স দ্বারা নিজস্ব কাজ উইকিমিডিয়া
২। "উল্টো ট্রান্সক্রিপশন পলিমারেজ শৃঙ্খল প্রতিক্রিয়া" দ্বারা Jpark623 - নিজস্ব কাজ (সিসি বাই-এসএ 3. 0) কমন্স মাধ্যমে উইকিমিডিয়া