এনজিএস এবং স্যাঙ্গার এস্কেন্ডিংয়ের মধ্যে পার্থক্য | এনজিএস বনাম স্যাঙ্গার এস্কেন্ডিং

কী পার্থক্য - এনজিএস বনাম স্যাঞ্জার এস্কেনসিং

পরবর্তী প্রজন্মের পরিসংখ্যান (এনজিএস) এবং স্যাঙ্গার এস্কেন্ডিং হচ্ছে দুই ধরনের নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সিং কৌশল যা সময়ের সাথে উন্নত হয়। Sanger Sequencing পদ্ধতি ব্যাপকভাবে বহু বছর ধরে ব্যবহার করা হয় এবং NGS এর সম্প্রতি তার সুবিধার কারণে এটি প্রতিস্থাপিত। NGS এবং Sanger Sequencing মধ্যে মূল পার্থক্য হল যে এনজিএস একটি sequencing সিস্টেমের মাধ্যমে দ্রুত ভাবে একসঙ্গে লক্ষ লক্ষ ক্রম sequencing নীতির উপর কাজ করে যখন Sanger Sequencing ডাইডিক্সিনে নিউক্লিয়াস এর নির্বাচক নির্বাচক কারণে চেইন সমাপ্তি প্রধান কাজ করে ডিএনএ পুনরাবৃত্তির সময় ডিএনএ পলিমেরেজ এনজাইম এবং কৈশিক ইলেক্ট্রোফোরিসোসের মাধ্যমে বিভক্ত fragments।

সুচিপত্র

1। সংক্ষিপ্ত বিবরণ এবং কী পার্থক্য

2 নিউক্লিওটাইড শৃঙ্খলা কি

3 এন জি এস

4 কি কি? স্যাঙ্গার এস্কেন্ডিং

5 সাইড তুলনা দ্বারা সাইড - এনজিএস বনাম স্যাঞ্জার এস্কেন্ডিং

6 সারসংক্ষেপ

নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সিং কি?

জেনেটিক তথ্য একটি জীব ডিএনএ বা RNA এর নিউক্লিওটাইড সিকুয়েন্সে সংরক্ষিত হয়। নিউক্লিওটাইডস (চারটি ঘাঁটি ব্যবহার করে) একটি সুনির্দিষ্ট টুকরা (একটি জিন, জিনের ক্লাস্টার, ক্রোমোজোম এবং সম্পূর্ণ জিনোম) -এর যথাযথ ক্রিয়া নির্ধারণের প্রক্রিয়াটি নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সিং নামে পরিচিত। জেনের গঠন এবং ফাংশন বিশ্লেষণ করার জন্য জিনোমিক গবেষণা, ফরেনসিক গবেষণা, জীবাণুবিদ্যা, জৈবিক পদ্ধতিগত, চিকিৎসা নির্ণয়ের, জৈবপ্রযুক্তি এবং অন্যান্য অনেক ক্ষেত্রে এটি খুবই গুরুত্বপূর্ণ। বিজ্ঞানীদের দ্বারা উন্নত বিভিন্ন ধরণের সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি আছে। তাদের মধ্যে, স্যাঙ্গার সিকোয়েন্সিং ফ্রেডরিক স্যাঙ্গার দ্বারা 1977 সালে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত এবং জনপ্রিয় হয়ে ওঠে পরবর্তী প্রজন্মের ক্রমানুসারী পর্যন্ত এটি দীর্ঘস্থায়ী।

--২ ->

এনজিএস কি?

পরবর্তী প্রজন্মের পরিসংখ্যান (এনজিএস) হল একটি শব্দ যা আধুনিক উচ্চ প্রান্তুপ ক্রমানুসারী প্রক্রিয়াগুলি বোঝায়। এটি বিভিন্ন আধুনিক সিকোয়েন্সিং টেকনোলজির বর্ণনা দেয় যা জেনেরিক স্টাডিজ এবং আণবিক জীববিজ্ঞানকে বিপ্লব করে। যারা কৌশলগুলি হল ইলুমিনা সিকোয়েন্সিং, রোচ 454 সিকোয়েন্সিং, আইওন প্রোটন সিকোয়েন্সিং এবং সোলিড (অলিগোগি লিজ ডিটেকশন দ্বারা ক্রমানুসারী) সিকোয়েন্সিং। NGS সিস্টেম দ্রুত এবং সস্তা হয়। এনজিএস পদ্ধতিতে চারটি প্রধান ডিএনএ সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি ব্যবহার করা হয়; pyrosequencing, সংশ্লেষণ দ্বারা sequencing, ligation এবং আয়ন সেমিকন্ডাক্টর সিকোয়েন্সিং দ্বারা sequencing। ডিএনএ বা আরএনএর সংখ্যার একটি বড় সংখ্যা (লক্ষাধিক) সমান্তরালভাবে ক্রমানুসারে রূপান্তরিত হতে পারে। এটি সামান্য সময়ের মধ্যে পুরো জিনোমের সিকোয়েন্সিংকে সেন্সর সিকোয়েন্সিংয়ের মতো করে তুলতে সাহায্য করে, যা বেশি সময় নেয়।

প্রচলিত সিকোয়েন্সিং স্যাঙ্গার পদ্ধতিতে এনজিএসের অনেক সুবিধা রয়েছে। এটি একটি উচ্চ গতিসম্পন্ন, আরো সঠিক এবং খরচ কার্যকর প্রক্রিয়া যা একটি ছোট নমুনা আকারের মাধ্যমে করা যেতে পারে। এনজিএস মেটাগনোমিক স্টাডিজে ব্যবহার করা যেতে পারে, সন্নিবেশ এবং মুছে ফেলা ইত্যাদি কারণে একটি পৃথক জিনোমের মধ্যে পার্থক্য সনাক্তকরণ এবং জিন এক্সপ্রেশনের বিশ্লেষণে।

চিত্র_1: এনজিএস ধারাবাহিকতায় উন্নতি

সাঙ্গারের ক্রমসজ্জার কি?

স্যাঞ্জার শৃংখলাটি একটি ডিএনএ ফ্র্যাগমেন্টের সুনির্দিষ্ট নিউক্লিওটাইড অর্ডার নির্ধারণের জন্য ফ্রেডরিক স্যাঙ্গার এবং তার সহকর্মীদের দ্বারা 1 9 77 সালে তৈরি একটি ধারাবাহিক পদ্ধতি। এটি চেন সমাপ্তি ক্রমানুসারে অথবা ডাইডিক্সি সিকোয়েন্সিং নামেও পরিচিত। ডিএনএপিপি, ডিডিটিপিপি, ডিডিএটিপি এবং ডিডিটিপিটি ডিএনএর পুনরাবৃত্তির সময় ডিএনএ পলিমারেজ দ্বারা চেইন ডাইন্ডোক্সিনে নিউক্লিওটাইডস (ডিডিএনএনপিপিএস) এর সিলেক্টিভ ইনক্লাকশন দ্বারা এই পদ্ধতির কার্যোপযোগী নীতিটি বন্ধ করা হয়। সাধারণ নিউক্লিওটাইডগুলির 3 টি 'OH গ্রুপগুলি এক্সাম্যান্স নিউক্লিওটাইডের মধ্যে ফসফোডিয়েস্টার বন্ধন গঠনের জন্য কাঠামো গঠন চালিয়ে যেতে থাকে। যাইহোক, DDNTPs এই 3 'OH গ্রুপ অভাব এবং nucleotides মধ্যে phosphodiester বন্ড গঠন করতে অক্ষম। অতএব, চেইন প্রসারিত বন্ধ হয়।

এই পদ্ধতিতে, সিঙ্গল-ফাঁকা ডিএনএ ক্রম অনুসারে ভেন্ড্রো ডিএনএ সংশ্লেষণের জন্য টেমপ্লেট ভান্ডার হিসাবে কাজ করে। অন্যান্য প্রয়োজনীয়তা হল oligonucleotide প্রাইমার, ডোক্সিনেলেলাসেট প্রারার্স এবং ডিএনএ পলিমেরেজ এনজাইম। যখন লক্ষ্যমাত্রা বিভাজকের ছিটকে শেষ হয়, তখন প্রাথমিকভাবে ডিএনএ রেপ্লিকেশনের জন্য ডিজাইনার করা যায়। চার পৃথক ডিএনএ সংশ্লেষণ প্রতিক্রিয়া চারটি আলাদা টিউব মধ্যে সঞ্চালিত হয়। প্রতিটি টিউব পৃথক ডিডিএনএএনপিপি রয়েছে, অন্যান্য প্রয়োজনীয়তা সহ। বিশেষ নিউক্লিওটাইড থেকে, ডিএনটিপি এবং ডিডিএনএএনপিপিগুলির মিশ্রণ যুক্ত করা হয়। একইভাবে, চারটি মিশ্রণে চারটি ভিন্ন ভিন্ন প্রতিক্রিয়াগুলি চারটি মিশ্রণে সঞ্চালিত হয়। প্রতিক্রিয়া পরে, ডিএনএ টুকরা সনাক্তকরণ এবং ক্রম তথ্য মধ্যে টুকরা প্যাটার্ন রূপান্তর সঞ্চালিত হয়। ডিএনএ টুকরা ফলাফল তাপ নিষ্ক্রিয় এবং জেল ইথোফোরিসিস দ্বারা পৃথক করা হয়। যদি তেজস্ক্রিয় নিউক্লিওটাইড ব্যবহার করা হয়, তাহলে পলিিয়াক্রাইলাইড জেলের ব্যান্ডিং প্যাটার্নটি অটোওডিজ্রোগ্রাফি দ্বারা দৃশ্যমান হতে পারে। যখন এই পদ্ধতিটি ফ্লোরোসেন্টলিঙ্কড ডাইডিক্সিনেকিয়ালোটাইড ব্যবহার করে, তখন এটি জেলের নিচে ক্ষয়প্রাপ্ত হতে পারে এবং ফ্লোরোসেন্ট ডিটেক্টর দ্বারা সনাক্ত করার জন্য লেজারের একটি মরীচি দ্বারা উত্তরণ করা যায়। একটি ক্রম চোখের দ্বারা পড়া হয় যখন আগত হতে পারে যে ত্রুটি এড়ানোর জন্য এবং কম্পিউটারের মধ্যে নিজে লিখুন, এই পদ্ধতি কম্পিউটারের সাথে মিলিত স্বয়ংক্রিয় sequencer ব্যবহার মধ্যে উন্নত।

এই হিউম্যান জিনোম প্রকল্প থেকে ডিএনএ ক্রম ব্যবহৃত পদ্ধতি। এই পদ্ধতিটি এখনও উন্নত পরিবর্তনগুলির সাথে ব্যবহার করা হয় কারণ এটি একটি ব্যয়বহুল এবং ধীর প্রক্রিয়া হওয়া সত্ত্বেও সঠিক ক্রম তথ্য দেয়।

চিত্র_2: স্যাঞ্জার এস্কেনসিং

এনজিএস এবং স্যাঙ্গার এস্কেনসিংয়ের মধ্যে পার্থক্য কি?

- টেবিলের মধ্যবর্তী বিবিধ ধারা মধ্যবিত্ত ->

এনজিএস বনাম স্যাঞ্জার শৃঙ্খলা
পরবর্তী জেনারেশন সিকোনসিং (এনজিএস) আধুনিক উচ্চ প্রান্তিক সিকোয়েন্সিং প্রসেস বোঝায়।এটি বিভিন্ন আধুনিক সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তির একটি সংখ্যা বর্ণনা করে	স্যাঞ্জার শৃঙ্খলা একটি নির্দিষ্ট ডিএনএ টুকরা সুনির্দিষ্ট নিউক্লিওটাইড ক্রম নির্ধারণ করার জন্য ফ্রেডেরিক স্যাঙ্গার দ্বারা তৈরি একটি সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি।
খরচ কার্যকারিতা
এনজিএস একটি সস্তা প্রক্রিয়া কারণ এটি সময় হ্রাস, মানুষ শক্তি এবং রাসায়নিক।	এটি একটি ব্যয়বহুল প্রক্রিয়া কারণ এটি সময়, মানুষ শক্তি এবং আরো রাসায়নিকের লাগে।
গতি
দ্রুততর হওয়ার পর থেকেই অনেক শনাক্তকারীর সনাক্তকরণ এবং সংকেত সনাক্তকরণ সমান্তরালে ঘটছে।	এটি সময়মতো গ্রহণ করা হয় যেহেতু রাসায়নিক সনাক্তকরণ এবং সংকেত সনাক্তকরণটি দুটি পৃথক প্রসেসের মতোই হয়ে থাকে এবং শুধুমাত্র একটি সময়ে একই সময়ে পড়তে পারে।
নির্ভরযোগ্যতা
এনজিএস নির্ভরযোগ্য।	স্যাঙ্গার সিকোয়েন্সিং কম নির্ভরযোগ্য
নমুনা আকার
এনজিএস কম পরিমাণ ডিএনএ প্রয়োজন	এই পদ্ধতিতে প্রচুর পরিমাণে টেমপ্লেট ডিএনএ প্রয়োজন।
প্রতিষেধক ফ্র্যাগমেন্টের ডিএনএ পদের সংখ্যা
স্যান্জার পদ্ধতির চেয়ে ডিএনএ ভিত্তিক ডিএনএ ভিত্তির সংখ্যা কম।	জেনারেটিং সিকোয়েন্সগুলি এনজিএস ক্রমগুলি থেকে লম্বা।

সংক্ষিপ্ত বিবরণ - এনজিএস বনাম স্যাঙ্গার এস্কেনসিং

এনজিএস এবং স্যাঞ্জার এসকেনসিং নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সিং কৌশলগুলি ব্যাপকভাবে মণিকুলার জীববিজ্ঞানে ব্যবহৃত হয়। Sanger সিকোয়েন্সিং একটি প্রথম ক্রমিং পদ্ধতি যা এনজিএস দ্বারা প্রতিস্থাপিত হয়। NGS এবং Sanger Sequencing মধ্যে প্রধান পার্থক্য হল যে NGS একটি উচ্চ গতি, Sanger sequencing তুলনায় আরো সঠিক এবং খরচ কার্যকর প্রক্রিয়া। উভয় কৌশল জেনেটিক্স এবং জৈবপ্রযুক্তি মধ্যে প্রধান প্রাদুর্ভাব তৈরি।

রেফারেন্স:

1 নওরোজিয়ান, মিনু "ইউক্যারিয়টিক মাইক্রোজিনজিসমের জন্য পরবর্তী-জেনারেশন সিক্যুনিসিং টেকনিক্স: জৈবিক সমস্যাগুলির জন্য শূন্যস্থান ভিত্তিক সমাধান। " ইউক্যারিওটিক কোষ. মাইক্রোবায়োলজি জন্য আমেরিকান সোসাইটি, সেপ্টেম্বর 2010. ওয়েব 18 ফেব্রুয়ারি 2017

২ স্যাঙ্গার, এফ।, এস। নিকিলেন, এবং এ। আর। কুলসন। "ডিএনএ সিকোয়েন্সিং ইনহিবিটরস সঙ্গে সিকোয়েন্সিং। "ন্যাশনাল অ্যাকাডেমি অফ সায়েন্সেসের পরীক্ষা 74. 1২ (1977): 5463-467। ওয়েব।

3। লিউ, লিন, ইনিহু লি, সিলিয়াং লি, নি হু, ইইমিন হেই, রে পং, দানি লি, লিহুয়া লু এবং ম্যাগি ল। "পরবর্তী জেনারেশন সিকুঞ্জিং সিস্টেম তুলনা "জৈবদাসবিদ্যা এবং জৈব প্রযুক্তি জার্নাল 2012 (2012): 1-11। ওয়েব।

চিত্র সৌজন্যে:

"স্যাঞ্জার-সিকেন্ডিং" ইস্তেভেজ - নিজের কাজ (সিসি বাই-এসএ 3. 0) কমিকস মাধ্যমে উইকিমিডিয়া

"পরবর্তী প্রজন্মের ধারাবাহিকতায় উন্নতি" নেডারব্র্যাগ্ট, লেক্স (২01২) - (সিসি বাই 3. 0) কমন্সে উইকিমিডিয়া মাধ্যমে